FtsK
FtsK est une translocase et une protéine du divisome d'Escherichia coli.
FtsK (Filamenting temperature-sensitive mutant K) est une translocase et une protéine du divisome d'Escherichia coli.
Rôle
Elle intervient à la fin de la réplication de l'ADN et est située au niveau du septum par une interaction avec FtsZ par l'intermédiaire des domaines N-terminaux des protéines, situés dans la membrane. In vivo, FtsK rend envisageable la résolution d'un dimère de chromosomes qui peut se former lors de la réplication de l'ADN (par des phénomènes de réparation nommés crossovers). Son rôle est alors de pomper l'ADN pour trouver les 2 sites dif (un par chromosome) où va avoir lieu un dernier événement de recombinaison homologue ; c'est un événement de recombinaison site-spécifique, qui implique la présence des tyrosine recombinases XerC et XerD fixées sur les sites dif. Quand ceux-ci sont alignés au niveau du septum par FtsK, une interaction entre FtsK et XerD active la recombinaison, un brin d'ADN est échangé et les deux chromosomes peuvent alors être scindés et ségrégués dans chacune des deux cellules filles[1].
La structure primaire de FtsK (1329 acides aminés) peut être divisée en trois parties :
- un domaine N-terminal, ancré dans la membrane par 4 hélices transmembranaires et interagissant avec certaines autres protéines du divisome pour assurer leur localisation ;
- un domaine «linker», particulièrement long (environ 600 acides aminés), riche en prolines et glutamines, dont la fonction n'est pas encore connue ;
- un domaine C-terminal qui a pour propriété de «s'hexamériser» avec d'autres domaines C-terminaux, formant ainsi un anneau autour de l'ADN. Ce domaine est le domaine moteur de la protéine, consommateur d'ATP, et autorise l'ADN d'être pompé à une vitesse d'environ 5 000 pb/s. Il classe ainsi FtsK dans la famille des AAA+ ATPases[2]. Ce domaine peut lui-même être divisé en trois sous-domaines α, β, et γ :
- α et β forment le moteur lui-même, possédant le site de liaison et d'hydrolyse de l'ATP. Le sous-domaine α est supposé effectuer un mouvement de levier après hydrolyse de l'ATP qui permettrait à l'ADN d'être «transloqué»[3].
- Le sous-domaine γ a quant à lui une activité de régulation de l'activité du moteur. Il est en effet capable d'interagir avec de courtes séquences d'ADN[4], qui sont orientées le long du chromosome pour pointer vers les sites dif. L'«hexamérisation» autour de ces séquences permet l'orientation de la translocation de FtsK vers les sites dif. Quand ceux-ci sont atteints, c'est à nouveau une interaction entre les sous-domaines γ et XerD qui va permettre l'activation de la recombinaison site-spécifique[5].
Notes et références
- ↑ (en) FtsK Is a DNA Motor Protein that Activates Chromosome Dimer Resolution by Switching the Catalytic State of the XerC and XerD Recombinases, Aussel et al., Cell (108), 2005
- ↑ ATPases associées à différentes activités cellulaires
- ↑ (en) Double-Stranded DNA Translocation : Structure and Mechanism of Hexameric FtsK, Massey et al., Molecular Cell (23), 2006
- ↑ Ces séquences d'ADN, longues de 8 pb, ont été surnommées KOPS à cause de leur rôle ici : FtsK-orienting polar sequences
- ↑ (en) Molecular Mechanism of Sequence-Directed DNA Loading and Translocation by FtsK, Löwe et al, Molecular Cell (31), 2008
- ↑ (en) FtsK Is a DNA Motor Protein that Activates Chromosome Dimer Resolution by Switching the Catalytic State of the XerC and XerD Recombinases, Aussel et al., Cell (108), 2005
- ↑ ATPases associées à différentes activités cellulaires
- ↑ (en) Double-Stranded DNA Translocation : Structure and Mechanism of Hexameric FtsK, Massey et al., Molecular Cell (23), 2006
- ↑ Ces séquences d'ADN, longues de 8 pb, ont été surnommées KOPS à cause de leur rôle ici : FtsK-orienting polar sequences
- ↑ (en) Molecular Mechanism of Sequence-Directed DNA Loading and Translocation by FtsK, Löwe et al, Molecular Cell (31), 2008
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