Spectrométrie de masse

La spectrométrie de masse est une technique physique d'analyse servant à détecter et d'identifier des molécules d'intérêt par mesure de leur masse mono-isotopique.



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La spectrométrie de masse (mass spectrometry ou MS) est une technique physique d'analyse servant à détecter et d'identifier des molécules d'intérêt par mesure de leur masse mono-isotopique. De plus, la spectrométrie de masse sert à caractériser la structure chimique des molécules en les fragmentant.
Son principe réside dans la séparation en phase gazeuse de molécules chargées (ions) selon leur rapport masse/charge (m/z). La spectrométrie de masse est utilisée dans quasiment l'ensemble des domaines scientifiques : physique, astrophysique, chimie en phase gazeuse, chimie organique, dosages, biologie, médecine...

Structure d'un spectromètre de masse

Structure d'un spectromètre de masse

Le spectromètre de masse, originellement conçu par le britannique Joseph John Thomson, comporte une source d'ionisation suivie d'un ou plusieurs analyseurs qui séparent les ions produits selon leur rapport m/z, d'un détecteur qui compte les ions et augmente le signal, et enfin d'un dispositif informatique pour traiter le signal. Le résultat obtenu est un spectre de masse représentant les rapports m/z des ions détectés selon l'axe des abscisses et l'abondance relative de ces ions selon l'axe d'ordonnées.

Le spectromètre de masse se compose par conséquent de quatre parties :

Ces analyseurs peuvent être couplés entre eux pour réaliser des expériences de spectrométrie de masse en tandem (MS/MS). Généralement, un premier analyseur sépare les ions, une cellule de collision sert à fragmenter les ions, et un second analyseur sépare les ions fragments. Certains analyseurs, comme les pièges à ions ou le FT-ICR, forment plusieurs analyseurs en un et permettent de fragmenter les ions et d'analyser les fragments directement.

A quoi sert la spectrométrie de masse ?

Les ionisations EI et CI, qui nécessitent un certain niveau de vide, sont préférentiellement utilisées en couplage avec la chromatographie en phase gazeuse (la CI fonctionnant à partir d'une source EI). Par contre, les deux sources à pression atmosphérique (électrospray et APCI) dites à "ionisation douce", sont essentiellement utilisées en couplage avec la chromatographie en phase liquide.

Source d'ionisation électronique

Des électrons émis par un filament rencontrent les molécules qui entrent dans la source : lors de la rencontre, si l'énergie cinétique des électrons est suffisante, un électron est arraché de la molécule M, la transformant en un ion radical M+o. Ce dernier peut ensuite se fragmenter suivant son énergie interne. L'EI conduit ainsi à un spectre assez apporté, avec de nombreux fragments, particulièrement riche en informations structurales.

Source d'ionisation chimique

En plus du système EI ci-dessus, un gaz réactif est introduit dans la source et ionisé par impact électronique. S'ensuit une série de réactions qui donne naissance à des ions pouvant réagir avec les molécules d'analyte arrivant dans la source. Ce type de réactions ions-molécules produit essentiellement (en mode positif) des ions [MH] +, et [M+adduit+H]+, donnant la possibilité ainsi d'accéder à la masse moléculaire de l'analyte.
Le méthane, l'isobutane et l'ammoniac sont parmi les gaz d'ionisation chimique les plus utilisés.

Source d'ionisation par électrospray

Son principe est le suivant : à pression atmosphérique, les gouttelettes de solutés sont constituées à l'extrémité d'un fin capillaire de silice, métallisé en surface et porté à un potentiel élevé. Le champ électrique intense leur confère une densité de charge importante. Sous l'effet de ce champ et grâce à l'assistance éventuelle d'un courant d'air co-axial, l'effluent liquide est transformé en nuage de fines gouttelettes (spray) chargées suivant le mode d'ionisation. Sous l'effet d'un second courant d'air chauffé, les gouttelettes s'évaporent progressivement en perdant des molécules de solvant par des mécanismes complexes de désolvatation et d'évaporation. Leur densité de charge devenant trop importante, les répulsions électriques atteignant le niveau des tensions superficielles, les gouttelettes explosent en libérant des microgouttelettes constituées de molécules protonées ou déprotonées de l'analyte, porteuses d'un nombre de charges variable.
Les ions ainsi constitués sont ensuite guidés avec potentiels électriques appliqués sur deux cônes d'échantillonnage successifs jouant le rôle de barrières avec les parties en aval maintenues sous un vide poussé (<10-5 Torr). Durant ce parcours à pression élevée, les ions subissent de multiples collisions avec les molécules de gaz et de solvant, ce qui complète leur désolvatation. En faisant fluctuer les potentiels électriques appliqués dans la source il est envisageable de provoquer des fragmentations plus ou moindres.
L'avantage de cette méthode d'ionisation comme pour l'APCI est l'obtention d'ions multichargés, pour les macromolécules, polymères. Elle permet d'autre part de générer une ionisation "douce" : surtout sont constitués des ions moléculaires

Les échantillons liquides sont directement introduits dans un nébuliseur pneumatique. Sous l'effet d'un jet d'air ou d'azote, le liquide est transformé en fin brouillard. Un chauffage assure la désolvatation des composés. Ces derniers sont ensuite ionisés chimiquement à pression atmosphérique : généralement, la phase mobile vaporisée joue le rôle de gaz d'ionisation et les électrons sont obtenus à partir de décharges d'électrode couronne. L'ionisation des composés est particulièrement favorisée lors de ces techniques car la fréquence des collisions est élevée à pression atmosphérique.
L'APCI est une technique analogue à l'ionisation chimique (CI), elle fait appel à des réactions ions-molécules en phase gazeuse, mais à pression atmosphérique et conduit principalement à la formation d'ions [MH]+ ou [M-H]-.

Source d'ionisation MALDI

Un faisceau laser pulsé est utilisé, le plus souvent dans le domaine des ultraviolets, pour désorber et ioniser un mélange matrice/échantillon cocristallisé sur une surface métallique, la cible.
Les molécules de matrice absorbent l'énergie transmise par le laser sous forme de photons UV, s'excitent et s'ionisent. L'énergie absorbée par la matrice provoque sa dissociation et son passage en phase gazeuse. Les molécules de matrice ionisées transfèrent leur charge à l'échantillon. L'expansion de la matrice entraîne l'échantillon au sein de la phase gazeuse dense où il va finir de s'ioniser.
L'ionisation de l'échantillon a par conséquent lieu soit dans la phase solide avant la désorption, soit par transfert de charge lors de collisions avec la matrice excitée après désorption. Elle conduit à la formation d'ions monochargés et multichargés de type [M+nH]n+, avec une nette prépondérance pour les monochargés.

C'est une petite molécule, capable de former des cristaux contenant l'analyte. Elle a pour propriété de fortement absorber à la longueur d'onde du laser. Elle assure ainsi la stabilité de l'échantillon, le préservant d'une dégradation trop importante par les photons.
Il est envisageable d'utiliser des matrices variées, dont énormément sont dérivées de l'acide cinnamique (acides gentisique (DHB), α-cyano-4-hydroxycinnamique (α-HCCA), sinapinique (SA), ... ). Cependant aucune règle générale ne régit vraiment leur choix pour une application, même si l'α-HCCA est fréquemment utilisé pour l'analyse de peptides, alors que le SA convient bien à l'étude des protéines.

Les analyseurs se différencient par leur principe de mesure du rapport m/z des ions, qui est :

  • la dispersion des ions, fondée sur leur moment ou leur énergie cinétique (instruments à secteur magnétique ou électrique)
  • la séparation dans le temps, fondée sur la vitesse des ions (TOF)
  • la transmission des ions traversant un champ électrodynamique (quadripôle)
  • le mouvement périodique dans un champ magnétique ou électrodynamique (pièges ou trappes à ions)

Un quadripôle est constitué de quatre électrodes parallèles de section hyperbolique ou cylindrique. Les électrodes opposées distantes de 2r0 sont reliées entre elles et soumises au même potentiel.

Coupe d'un quadripôle

Les électrodes adjacentes sont portées à des potentiels de même valeur, mais opposés de sorte que l'écart de potentiel soit égal à φ0.


Ce potentiel φ0 résulte de la combinaison de tensions, l'une continue (U) l'autre alternative (V) de haute fréquence f : \phi_0 = U - V\cdot cos (2\pi ft)

En appliquant cette différence de potentiel entre chaque paire d'électrodes, il se crée un champ électrique quadripolaire. Un point de coordonnées (x, y, z) localisé dans le champ électrique sera alors soumis au potentiel : \phi = \phi_0 \cdot \frac {xˆ2 - yˆ2}{r_0ˆ2}

Diagramme de stabilité d'un ion dans un quadripôle

La trajectoire d'un ion pénétrant dans le quadripôle sera par conséquent uniforme selon l'axe z et décrite par les équations de Mathieu selon les deux autres axes. Il est envisageable de définir suivant les valeurs U et V des zones de stabilité telles que les coordonnées x et y de l'ion restent strictement inférieures à r0. L'une d'entre elles est exploitée en spectrométrie de masse (voir figure) (Les ions qui se trouvent dans cette zone auront par conséquent une trajectoire stable dans le quadripole et seront détectés). En gardant constant le rapport U/V, on obtient une droite de fonctionnement de l'analyseur. Un balayage de U avec U/V constant permet l'observation successive de l'ensemble des ions dont la zone de stabilité est coupée par la droite de fonctionnement. La résolution entre ces ions est d'autant plus grande que la pente de la droite est élevée.

Schéma de la trajectoire stable d'un ion traversant le quadripôle

En l'absence de tension continue, l'ensemble des ions de rapports m/z supérieurs à celui fixé par la valeur de V appliquée auront une trajectoire stable (x et y < r0), le quadripôle est alors dit transparent et sert de focalisateur d'ions.

Les principaux avantages du spectromètre quadripolaire résident dans sa souplesse d'utilisation, sa résolution unitaire sur toute sa gamme de masse, sa vitesse de balayage satisfaisante, mais aussi son adaptabilité à différentes interfaces donnant la possibilité le couplage avec la chromatographie gazeuse ou liquide.

Analyseur octopolaire

Semblable à l'analyseur quadripolaire mais avec 8 électrodes, cet analyseur sert seulement à la focalisation des ions.

Le piège ionique quadripolaire ("trappe d'ions")

Schéma de la trajectoire des ions dans un piège ionique (en vert)

C'est un piège ionique où la préparation, l'analyse et la détection des ions s'effectuent dans un même espace, suivant des séquences temporelles successives.
Le piège est constitué de trois électrodes à section hyperbolique : une électrode annulaire encadrée par deux électrodes (d'entrée et de sortie) qui forment les calottes supérieure et inférieure du système. Une tension en radiofréquence V\cdot cos (2\pi ft) combinée ou non à une tension continue U est appliquée entre l'électrode centrale et les deux électrodes calottes. Le champ résultant est alors tridimensionnel.
Les domaines de stabilité des ions sont à nouveau déterminés par les équations de Mathieu. Celui exploité est défini tel que quand les ions en sortent, leur trajectoire radiale reste stable au contraire de celle selon l'axe des z. Un balayage de l'amplitude de la radiofréquence V entraînera par conséquent l'expulsion des ions piégés selon cet axe, vers le détecteur. Les trajectoires stables des ions, au sein du champ quadripolaire résultant sont tridimensionnelles, en forme de huit.

L'analyseur à temps de vol consiste à mesurer le temps que met un ion, soumis à une tension préalable, à parcourir une distance donnée.

En effet, l'énergie cinétique vaut :

E_c = \frac{1}{2} \cdot m \cdot vˆ2 = \frac{1}{2} \cdot m \cdot \frac{lˆ2}{tˆ2} m étant la masse, v la vitesse, l la distance parcourue au cours du vol, et t le temps de vol.
D'autre part, un ion de charge z soumis à une tension accélératrice V gagne une énergie cinétique

E_c = z \cdot e \cdot V

e étant la charge élémentaire.

On en déduit ainsi \frac{m}{z} = 2 \cdot e \cdot V \cdot \frac{tˆ2}{lˆ2}

Le rapport masse sur charge est directement mesurable à partir du temps de vol.

Un analyseur à temps de vol se compose d'une zone d'accélération où est appliquée la tension accélératrice, et d'une zone nommée tube de vol, libre de champ.


Trajectoire d'un ion dans l'analyseur à temps de vol en mode linéaire

Les ions accélérés pénètrent dans le tube de vol libre de tout champ. La séparation des ions ne va par conséquent dépendre que de la vitesse acquise lors de la phase d'accélération. Les ions de rapport m/z le plus petit parviendront au détecteur les premiers. Pour chaque groupe d'ions de même rapport m/z, un signal est enregistré au niveau du détecteur sous la forme d'une fonction temps/intensité.


Ce mode de détection comporte cependant certaines limitations en termes de résolution : ainsi deux ions semblables, de même vitesse d'origine, mais situés à deux points différents, entreront dans le tube de vol à des vitesses et des temps différents. Celui le plus loin du détecteur à l'origine sera accéléré plus longtemps et aura par conséquent un temps de vol plus court, d'où une dispersion en temps et en énergie. Le mode réflectron sert à pallier ce phénomène.


Trajectoire d'un ion dans l'analyseur à temps de vol en mode réflectron

En mode réflectron, un miroir électrostatique impose un champ électrique de direction opposée à celle du champ accélérateur d'origine, et par conséquent du mouvement des ions. Ces derniers voient ainsi leur trajectoire modifiée : ils pénètrent dans le réflectron et en ressortent avec une vitesse longitudinale de sens opposé à leur vitesse d'origine. Les ions les plus énergétiques arrivent les premiers au niveau du réflectron et vont y pénétrer plus profondément, ils seront par conséquent réfléchis dans un temps plus long. De cette façon, l'ensemble des ions de même rapport m/z se trouvent focalisés sur un même plan, le détecteur du réflectron étant positionné sur le plan de focalisation de ces ions.


En outre, le réflectron permet d'allonger la distance de vol sans pour tout autant augmenter la taille de l'analyseur : les ions mettent plus de temps pour atteindre le détecteur, et diminuent aussi leur dispersion en temps, la résolution s'en trouve par conséquent largement perfectionnée.

Schéma d'une cellule cubique ICR

L'analyseur à résonance cyclotronique d'ion se compose d'une cellule ICR (de configuration cubique par exemple) qui comporte surtout six plaques sous tension, isolées les unes des autres.

L'application d'un champ magnétostatique B suivant l'axe z soumet les ions à la force de Lorentz F = ez v ˆ B. Leur mouvement dans le plan (xy) est alors «cyclotronique», c'est-à-dire circulaire uniforme de fréquence f= eB/ (2π. m/z). Les ions sont d'autre part confinés suivant l'axe z par un champ électrostatique imposé par les deux plaques parallèles au plan (Oxy), résultant de l'application d'une tension faible.


Une fois piégés dans la cellule, les ions ont par conséquent la même trajectoire mais pas la même position à un instant déterminé (a).

Etapes de la spectrométrie de masse ICR : a) ions avant excitation, b) Excitation des ions jusqu'à atteindre une certaine orbite, c) mouvement cohérent des ions de même m/z créant le courant induit

Il convient par conséquent de donner aux ions de même m/z un mouvement d'ensemble en les mettant en phase, par résonance cyclotronique. Pour cela, les ions m/z sont excités par un champ alternatif de fréquence correspondant à leur fréquence cyclotron : pour exciter l'ensemble des ions d'une certaine gamme de m/z, une tension contenant l'ensemble des fréquences cyclotron correspondantes est imposée. Les ions sont alors accélérés, mis en phase et voient le rayon de leur orbite augmenter (b).


Le courant induit par le mouvement cohérent des ions de même m/z sera mesuré sur les plaques de détection (c)  : ce sera une sinusoïde amorti de fréquence cyclotronique. Le courant induit total mesuré sera par conséquent la somme de sinusoïdes amorties des fréquences cyclotroniques correspondant aux ions de m/z excités par résonance. La fréquence cyclotron étant proportionnelle à 1/ (m/z), l'inverse de la transformée de Fourier du courant obtenu permet d'aboutir au spectre de masse en m/z.


Cet analyseur a l'une des meilleures résolutions qui soient (Rs>100 000), par conséquent le spectre MS a une plus grande capacité de pics, ce qui maximise la quantité d'informations pour l'analyse de mélanges complexes. Cependant, la largeur des pics étant proportionnelle à (m/z) ², la résolution est meilleure aux m/z inférieures à 5000 Th. L'excellente précision du FT-ICR sur la mesure de masse (5-10 ppm) lève ou diminue les ambiguïtés sur l'identification des composés. La gamme de masse dépend de la valeur du champ magnétique, elle couvre jusque 27000 Da pour un champ de 7 T. Par contre, la gamme dynamique est assez restreinte, avec 2-3 décades, car cet analyseur par confinement souffre du même défaut que le piège quadripolaire, la cœxistence envisageable d'un nombre limité d'ions. Par conséquent, les pics particulièrement minoritaires dans le spectre de masse présenteront une mesure de masse moins précise. Le FT-ICR permet l'analyse en MS/MS dans la cellule même, avec possibilités variées d'activation des ions et par conséquent de fragmentations sélectives.

Trajectoire des ions dans un orbitrap (en rouge)

L'orbitrap se compose d'une électrode creuse, au sein de laquelle est positionnée coaxialement une électrode en forme de fuseau. La forme spécifique de ces deux électrodes permet l'imposition d'un champ électrostatique quadro-logarithmique avec la tension : \ U (r,z) = \frac{k}{2} \cdot (zˆ2 - \frac{rˆ2}{2}) + \frac{k}{2} \cdot Rmˆ2 \cdot ln ( \frac{r}{Rm} ) + C .
avec Rm rayon caractéristique de l'électrode centrale, k courbure du champ, et C une constante.
Le champ est surtout quadripolaire suivant l'axe z des électrodes. Les ions sont injectés tangentiellement à l'électrode centrale et piégés autour d'elle par la force électrostatique qui compense les forces centrifuges. Le mouvement des ions se décompose alors ainsi : un mouvement circulaire autour de l'électrode centrale dans le plan (xy) et un mouvement oscillatoire de va-et-vient selon l'axe z. Surtout, les ions d'un m/z donné seront sur la même trajectoire circulaire qui oscille axialement avec une fréquence f. f est indépendante de la vitesse ou de l'énergie des ions et s'exprime comme 1/2π√ (km/z). De la même façon que pour le FT-ICR, le courant induit par ces oscillations permet par une transformée de Fourier d'accéder aux m/z.


La précision des mesures de m/z est spécifiquement bonne (1-2 ppm) et la résolution (jusque 100 000) rivalise avec celle du FT-ICR, d'autant qu'étant proportionnelle à 1/√ (m/z), elle diminue moins vite avec le m/z que dans le cas du FT-ICR. La gamme dynamique est satisfaisante (> 3 décades). L'orbitrap est essentiellement utilisée en spectrométrie de masse en tandem, associée à un piège linéaire

L'analyseur à secteur magnétique

Schéma de la structure d'un spectromètre de masse : exemple d'un spectromètre de masse à secteur magnétique associé à une source d'ionisation d'impact électronique

L'ion est éjecté dans un milieu dans lequel règne un champ magnétique uniforme perpendiculaire au plan de la trajectoire. Du fait de la force de Lorentz, la trajectoire se courbe, et le point d'impact de l'ion (donc sa déviation) sert à connaître sa masse à partir de la charge.

En effet, soit \vec B\, le champ magnétique (dirigeant \overrightarrow{Oz}) de coordonnées \begin{pmatrix} 0 \\ 0 \\ B \end{pmatrix} et \vec v_0\, la vitesse d'origine orthogonale à \vec B\,, elle dirige \overrightarrow{Ox}.

On a alors : q \vec v \wedge \vec B = \begin{pmatrix} qB\dot y  \\ -qB \dot x  \\ 0 \end{pmatrix}.

D'où, en écrivant la relation principale de la dynamique : \left\{\begin{matrix} m \ddot x =qB \dot y  \\ m \ddot y = -qB \dot x \end{matrix}\right..

Soit : \left\{\begin{matrix} \ddot x -\omega_0\dot y  =0 \\ \ddot y + \omega_0\dot x=0 \end{matrix}\right.\omega_0=\frac{qB}{m}.

Posons \tilde V=\dot x + i\dot y.

On a alors \dot \tilde V + i\omega_0\tilde V=0.

En résolvant, \tilde V(t) =v_0 eˆ{-i\omega_0t}=v_0cos(\omega_0t) - v_0isin(\omega_0t) .

Et donc : \left\{\begin{matrix} \dot x(t) =v_0cos(\omega_0t) \\ \dot y(t) =-v_0sin(\omega_0t)\end{matrix}\right. \left\{\begin{matrix} x(t) =\frac{v_0}{\omega_0}sin(\omega_0t) \\ y(t) =\frac{v_0}{\omega_0}cos(\omega_0t) -\frac{mv_0}{qB}\end{matrix}\right.

(avec conditions initiales).

Il s'agit bien de l'équation paramétrique d'un cercle de rayon R_c=\frac{mv_0}{\left|qB\right|}.

Le spectromètre mesure ensuite les distances d'impact quand la particule a effectué un demi-cercle. La distance au point d'origine correspond au diamètre par conséquent au double du rayon donné par la dernière formule. La charge de la particule permet par conséquent d'en déduire sa masse.

La spectrométrie de masse en tandem (MS/MS)

Voir aussi : Séquençage par spectrométrie de masse

La spectrométrie de masse en tandem consiste à sélectionner un ion par une première spectrométrie de masse, à le fragmenter, puis à effectuer une deuxième spectrométrie de masse sur les fragments ainsi générés.
Elle peut être réalisée avec nombreux appareils combinant des secteurs magnétiques, électriques, quadripolaires ou des temps de vol, ainsi qu'au sein d'un même analyseur dans le cas d'une trappe d'ions.

Structure d'un triple quadripole

Un triple quadripôle résulte de l'association de deux analyseurs quadripolaires en série, scindés par une cellule de collision fréquemment constituée d'un quadripôle plus court. Cette combinaison de quadripôles sert à travailler en MS simple ou en tandem. Pour réaliser une acquisition en MS, il suffit de n'appliquer qu'une tension alternative à l'un des analyseurs pour le rendre "transparent" comme la cellule de collision, celle-ci ne contenant alors pas de gaz.

Lors d'une acquisition en MS/MS, la cellule de collision est remplie d'un gaz inerte (argon par exemple) sous une pression assez élevée (10 − 2 torr). L'énergie cinétique de l'ion choisi est convertie lors de ses collisions successives en énergie interne. La dissociation de l'ion se réalisera quand son énergie interne sera devenue supérieure à l'énergie d'activation indispensable à la fragmentation. Cette technique de dissociation activée par collision (CAD) peut être augmentée en augmentant l'énergie cinétique des ions choisies par application d'une différence de potentiel entre la source et la cellule de collision.
L'analyse MS/MS peut être menée selon quatre modes différents selon l'information recherchée : le mode descendant est le plus utilisé pour obtenir des informations structurales, les deux modes (ascendant et perte de neutre) sont d'un usage plus restreint et permettent de mettre en évidence des ions ayant des particularités communes. Le quatrième mode (Multiple Reaction Monitoring ou MRM), dérivé du mode descendant, est voué à la quantification.

  • en mode descendant, l'ion à étudier est choisi en focalisant le premier analyseur sur son rapport m/z. Les fragments constitués dans la cellule de collision sont scindés par le deuxième analyseur et analysés. Le spectre obtenu présente à la fois l'ion précurseur (ou ion parent) et ses ions fragments (ou ions produits).
  • en mode ascendant, le premier analyseur balaie une gamme de masse alors que le deuxième est focalisé sur un seul rapport m/z. L'ensemble des ions générés en source et capables de donner un fragment de même rapport m/z seront par conséquent ainsi détectés.
  • en mode perte de neutre, les deux analyseurs balaient une gamme de masse simultanément et avec un décalage de masse constant. Le spectre établi présentera alors l'ensemble des ions parents capables de se fragmenter en générant un neutre de masse égale au décalage imposé.
  • en mode MRM, l'ion parent à étudier est choisi par le premier analyseur et fragmenté dans la cellule de collision, comme en mode descendant. Par contre, le second analyseur est focalisé sur l'ion produit. Ce mode de fonctionnement présente une double sélectivité, au niveau des sélections de l'ion parent et de l'ion produit. En outre les deux analyseurs étant fixées à des tensions constantes, la sensibilité de détection est perfectionnée comparé à d'autres modes de balayage, faisant de la MRM un mode de choix pour la quantification.

MSn en piège quadripolaire ("trappe d'ions")

Au sein d'un piège quadripolaire ("trappe d'ions"), l'analyse en tandem se réalise tout d'abord par sélection d'ions dont la valeur m/z est choisie. Ces ions piégés vont ensuite se fragmenter par collision (acquisition d'énergie interne, excitation vibrationnelle) avec une tension RF (radiofréquence) correspondant à leur fréquence de résonance, et les ions produits constitués sont à leur tour piégés. Une éjection sélective en masse des ions produits (fragments) peut alors être réalisée en vue de leur analyse.
L'obtention d'ions de générations supérieures est envisageable par simple renouvellement du processus (sélection d'un ion produit, fragmentation, sélection d'un ion produit de 2e génération, fragmentation, etc... ). Cette séquence est nommée MSn, n étant le nombre de générations d'ions. Ainsi la MS2 est la MS-MS et ainsi de suite...

Associer plusieurs types d'analyseur dans un spectromètre de masse en tandem sert à combiner les points forts des deux types d'analyseurs.

  • Quadripôle/temps de vol :

Ces appareils nommés Q-TOF sont constitués d'un double quadripôle (1er analyseur + cellule de collision) et d'un analyseur à temps de vol comme second analyseur. Le quadripôle procure ainsi une grande efficacité au processus MS/MS, alors que le TOF apporte son excellente sensibilité, sa grande rapidité d'analyse et ses résolution et précision en masse bien meilleure sur les ions produits, comparé à une configuration triple quadripôle. Cependant ces instruments sont limités par la faible gamme dynamique du TOF.

  • Quadripôle/trappe d'ions :

Cette combinaison permet d'éviter les problèmes de charge d'espace associés à la trappe d'ions. La trappe apporte une meilleure sensibilité et une vitesse d'analyse plus rapide. En outre, comparé à une trappe simple, cette combinaison autorise l'ensemble des modes d'acquisition MS/MS du triple quadripôle (perte de neutre et mode ascendant).

  • Trappe/FT-ICR ou Trappe/Orbitrap :

L'objectif de ce genre d'association est d'obtenir une précision en masse et une résolution, qui soient toujours meilleures qu'avec un TOF comme deuxième analyseur.

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